更换机动车号牌后扣留6个月的情况下，更换号牌的流程分三步：

第一步，到当地公安车辆管理站填写《变更表》，一式两份，并按表栏要求填写行驶证。同时需要加盖与原登记相同的公章，车主申请栏需加盖新车主公章。

第二步，新车车主需要收到《机动车登记表》一式三份，并加盖新车车主印章。同时，要清晰地贴好发动机、车架号码拓印，并到当地公安车辆管理站办理送检手续。经车辆管理站签字填写意见后，更名表就办理完成。

第三步，需要进行车牌过户流程。在车辆管理业务窗口办理过户登记时，车辆管理业务员需要在《机动车登记表》审核意见栏填写意见，并对原登记簿和行驶证相应给予注册签名。在电脑上办理牌照过户登记后，经值班科指导复核后，在收费站支付相关费用，并再次制作牌照。