首先，VR6和V6发动机在结构上有很大的区别。VR6发动机采用倾斜气缸的设计，使得两个气缸组成一个V型，而V6发动机则是将六个气缸均匀地分成两组，形成一个V型。这种设计使得VR6发动机能够在体积相对较小的情况下发挥出V6发动机同样的功率，并且具有更流畅的受力和更高的可靠性。

其次，VR6发动机具有更高的性能和动力输出。VR6发动机采用了直列发动机、V型发动机和对角发动机的优势结合，使得VR6发动机具有更大的缸径和行程，更大的气门面积和接近V8发动机的扭矩输出。因此，它相对于V6发动机更加强大，给驾驶者带来更好的行驶体验。

最后，VR6发动机较为罕见，V6发动机则更加常见。由于VR6发动机的制造难度和成本较高，因此它在市场上不如V6发动机普及。但是，VR6发动机仍然被许多汽车制造商使用在高端车型中，例如大众和奥迪等汽车品牌。

总之，VR6和V6发动机各有特点，可以根据不同的需求和使用场景来选择。VR6发动机强大的性能和动力输出，在高端车型中具有一定的市场优势。而V6发动机由于普及程度更高，更能符合大众消费者的需求。