发动机故障灯闪烁、晃动、抖动的原因如下：

1. 发动机的进气可能会吸收少量水分，所以需要检查空气滤清器；

2. 涉水时排气阻力大，导致排气不畅，造成短时多油少气现象，汽油燃烧不充分。

发动机出现闪灯、晃动、抖动等故障问题的解决方法如下：

1. 检查水温表和机油压力警告灯；

2. 如果水温过高或者机油压力警示灯亮起，可以明显体验到车辆故障的问题。

您应该立即靠边停车并呼叫救援，以防止发动机性能受到影响。