奔驰S和E的价格、等级、车身尺寸和动力总成都有所不同。新型S级全系基本采用3.0升涡轮增压发动机，而奔驰E的排量比S级大，共使用三种发动机，分别是1.5升涡轮增压发动机、低功率版2.0升涡轮增压发动机和高功率版2.0升涡轮增压发动机。

此外，奔驰S的配置和舒适性都比奔驰E更高。奔驰S的轴距为3156mm，长、宽、高分别为5259mm、1899mm和1497mm，而国产奔驰E的轴距为3079mm，长、宽、高分别为5065mm、1860mm和1484mm。奔驰E国产版车型基本都是长轴距车型，进口版车型则是标准轴距车型，进口版奔驰E还有双门轿车和敞篷车可选，但国产版机型没有双门版和开放式版的机型。

奔驰S也有双门和敞篷车型，但定位和奔驰E级不同，S级是奔驰的旗舰产品，是奔驰的大型豪华汽车，而奔驰E是中高端产品，是中大型车，目标车型分别是宝马5系、奥迪A6L等和宝马7系、奥迪A8L等。