机动车故障灯的原因有以下几点：

1. 尾气排放不达标。例如燃油不良、三元催化器故障、进气管积碳过多、喷油嘴堵塞、氧传感器故障、发动机偶尔熄火等。这些都会导致发动机故障灯亮起。其中油质不良会导致发动机故障灯亮起最多。

2. 发动机系统操作不良引起的故障灯。例如油门踏板传感器、油门位置传感器、空气流量计、曲轴位置传感器等，或线路接触不良等。会导致发动机故障灯点亮。

3. 有些车辆变速箱系统故障也是由发动机故障灯指示的。例如变速箱内部故障、打滑、温度过高等。