日产琦君发动机故障灯的原因如下:

1. 尾气排放不达标，具体问题包括燃油不良、三元催化器失效、进气管积碳过多、喷油器堵塞、氧传感器失效和发动机偶尔熄火等。其中，油质差是导致发动机故障灯点亮最多的原因。

2. 发动机系统操作不良也会导致故障灯点亮，例如油门踏板传感器、油门位置传感器、空气流量计和曲轴位置传感器出现问题，或是线路接触不良等。

3. 有些车辆的变速箱系统故障也可能导致发动机故障灯点亮，例如变速箱内部故障、打滑或温度过高等。

因此，如果遇到上述问题，会引起发动机故障灯点亮。